วันที่ 1 กันยายน เวลาประมาณ 11.00 น. พล.ต.ศรีศักดิ์ พูนประสิทธิ์ ผู้บัญชาการกองกำลังบูรพา ได้สั่งการให้ พ.อ.ปรมาธร บุนนาค ผบ.ฉก.กรม.ทพ.12 กกล.บูรพาและ ร.อ.อภินันท์ สงครามชัย ผบ.ร้อย ทพ.1201 ประสานความร่วมมือกับ พ.ต.ท.เบญจพล รอดสวาสดิ์ รอง ผกก.ตม.จว.สระแก้ว และ พ.ต.อ.เสกสรร วัฒนพงษ์ ผกก.สภ.คลองลึก จ.สระแก้ว ประสานกำลังสกัดกั้นการหลบหนีออกนอกประเทศของผู้ก่อเหตุ ระเบิดแยกราชประสงค์ บริเวณทิศเหนือตลาดโรงเกลือห่างจุดผ่านแดนถาวรบ้านคลองลึก ประมาณ 3 กม. ซึ่งเป็นจุดล่อแหลมไม่มีเขตแดนทางธรรมชาติกั้นแนวชายแดน ที่ผู้ต้องหาที่ถูกออกหมายจับอาจใช้เป็นเส้นทางหลบหนีออกนอกประเทศ
จนกระทั่งทหารพรานและชุดปฏิบัติการร่วมลาดตระเวนมาตามถนนศรีเพ็ญซึ่งเป็นถนนเลียบแนวชายแดน มาถึงบริเวณป่าละเมาะริมชายแดน เขตพื้นที่บ้านดงงู ต.ป่าไร่ อ.อรัญประเทศ จ.สระแก้ว ได้ตรวจพบชายต้องสงสัยเดินสะพายกระเป๋าเป้สีดำ เดินผ่านป่าละเมาะมุ่งหน้าสู่เขตแดนกัมพูชา เจ้าหน้าที่จึงนำกำลังเข้าปิดล้อมและสามารถสกัดจับไว้ได้ก่อนที่ผู้ต้องสงสัยจะสามารถลักลอบข้ามตะเข็บชายแดน เบื้องต้นพบว่าเป็นชายชาวต่างชาติ ใบหน้าและลักษณะคล้ายภาพสเกตช์ผู้ต้องหาชาวต่างชาติที่ลอบวาง ระเบิดแยกราชประสงค์ ทำให้มีคนเสียชีวิตและบาดเจ็บจำนวนมาก โดยศาลได้ออกหมายจับตามภาพวงจรปิด จึงควบคุมตัวมาไว้ที่กองร้อยทหารพรานคลองลึก หน้าด่านพรมแดนอรัญประเทศ จ.สระแก้ว
จากการตรวจค้นภายในกระเป๋าเป้สีดำของชายชาวต่างชาติดังกล่าว พบว่ามีเสื้อผ้า และกางเกงขาสามส่วน ซึ่งลักษณะคล้ายกางเกงที่สวมใส่ในวันก่อเหตุ จากนั้นจึงประสานไปยัง พล.ต.อ.จักรทิพย์ ชัยจินดา รองผู้บัญชาการตำรวจแห่งชาติ ที่นั่งเฮลิคอปเตอร์ จากกรุงเทพฯ มารับตัวผู้ต้องสงสัยรายนี้ด้วยตัวเอง และ นำตัวไปสอบสวนต่อที่ กรุงเทพฯ เนื่องจากผู้ต้องสงสัยยังไม่ทราบสัญชาติ และใบหน้าลักษณะคล้ายผู้ต้องหาวาง ระเบิดแยกราชประสงค์
อย่างไรก็ตาม รายละเอียดอื่นๆ นั้นยังไม่เป็นที่เปิดเผย และเจ้าหน้าที่ขอสงวนชื่อทั้งหมดของผู้ที่ถูกจับกุม รวมถึงหลักฐานอื่นๆ อย่างไรก็ตาม ชุดจับกุมเชื่อว่าน่าจะเป็นบุคคลเดียวกันกับมือวาง ระเบิดแยกราชประสงค์ ที่ถูกออกหมายจับ
ต่อมา พล.อ.ประยุทธ์ จันทร์โอชา นายกรัฐมนตรี และหัวหน้า คสช. ยืนยันว่า ได้จับกุมชายต่างชาติเสื้อเหลือง ผู้ต้องสงสัยวาง ระเบิดแยกราชประสงค์ ซึ่งเป็นตัวแปรสำคัญ ได้แล้วที่ชายแดนไทย-กัมพูชา พื้นที่บ้านป่าไร่ อ.อรัญประเทศ จ.สระแก้ว ขณะกำลังหลบหนี หลังทราบข่าวเมื่อคืนนี้ ว่ากำลังหลบหนีไปชายแดนกัมพูชา จึงส่งกำลังเจ้าหน้าที่เข้าตรวจสอบ กระทั่งจับตัวได้ ซึ่งเพิ่งได้รับรายงานมา ขณะกำลังประชุม ครม. โดยนำตัวมา กทม.เพื่อสอบสวนขยายผลหาผู้ร่วมขบวนการ
ภาพจาก Thairath